村里暗箱操作转移党组织关系，这合法吗？

不合法。依据《中国共产党章程》，党员转移组织关系需经党组织批准，并办理正规手续。《党章》规定未经批准擅自转移党组织关系是违规的，可能破坏党内秩序，影响党员管理，甚至导致党纪处分。
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常见处理方式为向党委反映或举报。若确存在暗箱操作，应向上一级党委或纪委反映情况，要求调查处理。选择处理方式时，需考虑证据充分性及反映渠道的正式性，确保问题得到有效解决。
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不合法，应反映。操作如下：1.收集证据，如会议记录、通信记录等；2.向村党委或上一级党委提出书面反映，说明情况；3.如无回应或处理不当，可向纪委或组织部门举报，要求介入调查；4.必要时，可寻求法律援助，维护合法权益。